顺应潮流:仅血浆ctDNA-MRD检测的分析方法前景!

2022-02-14 14:02:26 来源:
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"丝氨酸被纳入MRD侦测的吸引力是指明的,渴望这些十分困难将一直大幅提较低将来MRD侦测的效能。"

年前列腺癌的MRD侦测是一种精准且特异的用以检测年前列腺癌肿瘤肠道中所源特质遗传物质(如ctDNA)相对总数的方式。在这种状况下,肿瘤没有见光可见的恶性肿肿瘤,但似乎共存规格诊断影像方式无法侦测到但最终都会导致年前列腺癌病情恶化的凝小恶性肿肿瘤。

MRD,常称为凝小完好无损恶性肿肿瘤(Minimal Residual Disease)。用作“Minimal” (凝小)这个该词,是因为它在手抄本和诊断技术人员中所格外常用。不过,“Minimal”这个该词确实兼具“误导特质”,因为低素质的肿瘤在肾功能和放射治疗对政府之外也确实兼具不可忽视意义。“Measurable”(可校准)一该词可格外精确地所述完好无损在病人体内的肿肿瘤细胞的共存。NCCN指南同时用作了“Minimal Residual Disease”(凝小完好无损恶性肿肿瘤)和“Measurable Residual Disease”(可校准完好无损恶性肿肿瘤)两个术语。

此外,可行特质深入研究声称在小分子素质上侦测多种年前列腺癌各种类型的ctDNA或多或少兼具诊断必要,手抄本和诊断技术人员有时也都会用作“Molecular Residual Disease”(小分子完好无损恶性肿肿瘤)一该词。

持续发展,国内外在实质中所基于ctDNA的MRD评核(ctDNA-MRD)的诊断数据和确凿证据日渐多,开启了实质肿瘤MRD侦测的热潮。实质肿瘤ctDNA-MRD侦测的新技术流派主要有两大类:

1)Tumor-informed assays(告知统计分析)

对原发该组织顺利完成较低通量以检验肿瘤的特异遗传物质组人体内图集,然后外观设计模板选用panel或用作基本上panel顺利完成个特质化的ctDNA侦测统计分析。

2)Tumor-uninformed assays(不告知统计分析)

也可以称为Tumor-agnostic assays或Tumor-naïve assays,即并不需要原发该组织,至少相关联三组先行挑选出模板/探针外观设计的与年前列腺癌各种类型相关的基本上panel顺利完成ctDNA侦测统计分析,平常侦测ctDNA特异性的同时,借助于ctDNA丝氨酸或片断组习等三组习方式。补救了该组织抽样偏低或检测底物偏低或TAT过长等问题。

Tumor-informed assays的新技术作法格外合乎大众所的感知,在保证较低特异特质的必需下,可通过检测多底物的sample-level(抽样素质)大幅大幅提较低其较低频率,新技术投票率相对来说不是同样较低。Tumor-uninformed assays的新技术作法格外值得注意早筛,通过大幅提较低site-level(底物素质)侦测较低频率并借助于ctDNA丝氨酸或片断组习并联合机器习习算法大幅大幅提较低其较低频率和特异特质,新技术投票率相对来说较较低。

2021年4年初29日,《Clinical Cancer Research》因特网刊登了“至少用作血清ctDNA侦测合胃癌肿瘤凝小完好无损恶性肿肿瘤(MRD)”的文章,首次公开了Guardant Reveal的深入研究数据:MRD侦测较低频率达到91%,特异特质达100%,这些发掘出支持者了至少血清ctDNA-MRD侦测(Tumor-uninformed assays)的潜在诊断应用于。

2021年8年初13日,《Clinical Cancer Research》因特网刊登了“顺应潮流:至少血清ctDNA-MRD侦测的应用于年前景”的文章,在这里人类习家们咨询评核了至少血清ctDNA侦测MRD的技能,以及将丝氨酸构建到ctDNA侦测的潜在必要。2

Parikh及其朋友1 和Taieb及其朋友3 咨询了至少血清ctDNA-MRD侦测在合胃癌(CRC)肿瘤中所的潜在诊断应用于。

▲ ctDNA丝氨酸和特异性在两项深入研究中所的应用于比较(Parikh和Taieb)

合胃癌(CRC)的放射治疗始终面对着着一个挑战,即极少的CRC肿瘤因20世纪疾病病情恶化而过早死亡。尽管诊断改用了规格的专用放射治疗,但较低有确实IIIC期CRC肿瘤的5年生存率也至少有53%,正因如此是没有发掘出影像习上未侦测到的凝小完好无损恶性肿肿瘤(MRD)。4

现今,仍当务之急精确相符哪些肿瘤术后共存MRD,以帮助他的习生降低或缩减专用放射治疗,并缩减治愈的确实特质,同时最大限度地降低不致放射治疗的相关毒特质。

在过去的几年里,我们对ctDNA在CRC诊断和肾功能中所的应用于有了广泛的了解到。现今,基于ctDNA的MRD评核时是广泛应用于以年前列腺癌的放射治疗中所。

ctDNA是由DNA的预告片断一组(将近130-150bp),由肿肿瘤细胞通过不可逆转、炎症或分泌拘禁到循环系统中所。 ctDNA的半衰期过长都因其成为极端的实时超重圣万,它的共存确实反映了影像习上好像的凝转移。

在治愈特质放射治疗过后后,ctDNA中所借助于现的细胞核特异性对随后的影像习病情恶化兼具较较低的阳特质数据分析价值,同样是当这些特异性与手术的该组织中所的特异性相匹配时。侦测这种ctDNA度量的MRD可以在I-III期CRC中所提年前影像习数年初数据分析病情恶化,从而为三组最终都会病情恶化的CRC肿瘤包括一个评核新疗法的窗口。然而,这些ctDNA基本概念特异性度量的MRD侦测方式的较低频率始终是依赖于的,当务之急改进其侦测效能。

ctDNA的丝氨酸侦测优于ctDNA的基本概念特异性侦测。ctDNA的丝氨酸精神状况在CRC中所非常少见,并被视为大多数癌变的20世纪阶段性。这种丝氨酸,具体度量为DNA中所丝氨酸的C5位置添加甲基配体,调节附近遗传物质的解读,最主要定格的矜癌遗传物质失活。与基本概念特异性远比,CRC中所共存格外多的丝氨酸精神状况区外,为大幅提较低MRD侦测的较低频率包括了机都会。SEPT9,就是第一个利用肠道侦测单遗传物质丝氨酸精神状况顺利完成筛查和20世纪侦测CRC的方式。尽管ctDNA丝氨酸有这些优点,但这些相同的特特质也必需审慎,以保持良好侦测统计分析的特异特质,并尽量降低;也阳特质的确实特质。

在这种背景下,Parikh和Taieb的都将最新深入研究合果为我们对ctDNA效能的思考包括了依赖于的足量,即并不需要原发该组织,至少通过肠道ctDNA丝氨酸或联合ctDNA特异性即可顺利完成精确的MRD评核。与其他必需对原发该组织顺利完成较低通量以他的习生后续ctDNA统计分析的侦测不同,都将深入研究阐释了Tumor-uninformed assays的有效特质,它有几个占优势,最主要更快的TAT,降低初始成本,对该组织偏低或不必需的肿瘤顺利完成检测。

Parikh等人包括了一种ctDNA丝氨酸联合ctDNA基本概念特异性的基本上panel顺利完成MRD的统计分析评核(NGS方式),与其他金融业上必需的MRD侦测方式远比,这种方式不必需手术的该组织以及选用化。在最终放射治疗后用作时,这种至少血清ctDNA-MRD侦测对病情恶化兼具诊断意义的特异特质(100%)和较低频率(55.6%),通过构建凝小遗传物质组特征和纵向检测统计分析,其较低频率可大幅大幅提较低至91%。1 该方式被用以时是在顺利完成的年前瞻特质深入研究,最主要他的习生IIA期心肌梗塞放射治疗对政府的NRG共同开发组深入研究(NCT04068103)。虽然还必需额外的数据集来测试这些发掘出,但这些合果确实了基于ctDNA的MRD侦测在不告知的情况下可接受的侦测效能特征。

Taieb等人的深入研究利用了一对先年前被确实是CRC手术后肾功能相关的丝氨酸遗传物质标上物WIF1和NPY(ddPCR方式),并将它们应用于以PRODIGE-GERCOR IDEA-France试验,将III期CRC肿瘤随机分为3个年初 vs 6个年初的专用抗生素。在对积极参与III期试验的III期CRC肿瘤顺利完成的首次ctDNA-MRD评核中所,有13.8%的肿瘤术后为ctDNA-MRD阳特质,并被确认为独立的肾功能圣万。3 同时,人类习家也指借助于,与其他改用NGS方式的ctDNA-MRD深入研究远比,本深入研究中所ctDNA的阳特质率较少。较低频率和PPV或多或少很低NGS侦测合果,ctDNA-MRD阳特质和阴特质的5年DFS则有65%和73%,尽管专用放射治疗的和不理想的年前统计分析抽样处理过程确实都会对这些合果显现出严重影响。该方式值得注意的是其相对简单,非常低的成本和潜在的复原特质,不必需金融业侦测中所所见的专利侦测方式。时是在顺利完成的年前瞻特质深入研究将进一步评核至少血清ctDNA侦测是否很难精确评核MRD,以便对CRC肿瘤顺利完成有确实各别,并他的习生专用放射治疗对政府。

无论改用何种方式,至少用血清ctDNA-MRD侦测来他的习生CRC肿瘤的放射治疗同意,必需可靠且精确的侦测方式。需大幅大幅提较低至少血清ctDNA-MRD侦测的较低频率来相符哪些肿瘤可以从放射治疗再降中所获益,以能避免不恰当地考虑较低危肿瘤接受较少强度的放射治疗。Parikh及其朋友的深入研究合果辨识,构建遗传物质组和凝小遗传物质组以及纵向血清检测,可总体大幅提较低至少血清ctDNA-MRD的较低频率。远比之下,ctDNA-MRD侦测的较低特异特质对于ctDNA作为一个完整的生物圣万来相符放射治疗升级是至关不可忽视的。由于特异特质偏低,;也阳特质的ctDNA-MRD确实都会使肿瘤接受不致的强化放射治疗。Parikh及其朋友的深入研究合果确实,除基本概念特异性外,还可以通过联合凝小遗传物质组丝氨酸特征的统计分析来保持良好特异特质。Taieb等人的统计分析方式的占优势在于大幅提较低了诊断特征的较低频率和肾功能,但是,时是如人类习家认定的那样,基本上的两个遗传物质丝氨酸标上确实无法包括与联合基本概念特异性方式的效能特征。不可忽视的是,这项兼职也强调了国际规格统计分析年前条件的不可忽视特质,因为各种提取方式可以在相当大程度上严重影响ctDNA的得率和完整特质。在将来的深入研究中所,这些统计分析年前的考虑将来得日渐不可忽视。

丝氨酸被纳入MRD侦测的吸引力是指明的,渴望这些十分困难将一直大幅提较低将来MRD侦测的效能。总之,至少血清ctDNA-MRD的侦测包括了一个独特的机都会,用作一种无创方式来冒险放射治疗可行性,并有确实根除较低危肿瘤的凝转移特质恶性肿肿瘤。这些深入研究合果无疑为将来ctDNA-MRD他的习生的年前瞻特质诊断试验开端了较低架道路。

MRD,始终是一个更快转型的领域,我们预计近两年确实都会借助于现新的确凿证据,要么辨识借助于MRD侦测的诊断必要的局限特质,要么辨识借助于MRD侦测的其他占优势和新用处。

其所:

1.Parikh Aparna R,Van Seventer Emily E,Siregna Giulia et al. Minimal Residual Disease Detection using a Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assay in Colorectal Cancer Patients.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

2.Bent A, Kopetz S. Going with the Flow: The Promise of Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assays. Clin Cancer Res. 2021 Oct 15;27(20):5449-5451.

3.Taieb Julien,Taly Valerie,Henriques Julie et al. Prognostic value and relation with adjuvant treatment duration of ctDNA in stage III colon cancer: a post-hoc ysis of the PRODIGE-GERCOR IDEA-France trial.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

4.Benson Al B,Venook Alan P,Cederquist Lynette et al. Colon Cancer, Version 1.2017, NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology.[J] .J Natl Compr Canc Netw, 2017, 15: 370-398.

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